Studi Literatur : Molekular Docking Senyawa Anti Covid-19 terhadap Enzim 3c-Like Protease
Main Article Content
Abstract
Latar Belakang : Organization (WHO) menyatakan COVID-19 sebagai pandemi pada 11 Maret 2020 (Kementerian Kesehatan Republik Indonesia, 2020). COVID-19 menyebar dengan cepat melalui transmisi kontak, aerosol, dan droplet). SARS-CoV-2 adalah virus beta-korona yang menginfeksi saluran pernapasan bagian atas (yaitu sinus, hidung, dan tenggorokan) dan saluran pernapasan bagian bawah (yaitu tenggorokan dan paru-paru). Pasien biasanya mengalami gejala mulai dari ringan hingga berat yang mengancam jiwa, termasuk batuk, sakit tenggorokan, demam, dispnea, kelelahan, diare, sindrom gangguan pernapasan akut, sepsis dan syok septik Tujuan: mengetahui interaksi senyawa anti virus dengan enzim papain-like protease pada covid-19 melalui penambatan molecular untuk memprediksi sifat makromolekul protein Metode: studi literatur. Hasil: beberapa tumbuhan memiliki sifat anti covid, 9 senyawa uji anti virus yang di docking dengan enzim Papain-like protease menghasilkan senyawa uji terbaik yaitu umifenovir. Catechin gallat (CG) memiliki score docking -11,407 dan epicatechin gallat (ECG) memiliki score docking -111.391. Kedua senyawa ini memiliki potensi sebagai alternative pengganti remdesivir dalam menghambat main protease SARS-CoV-2.
Kata Kunci : Anticovid-19, Molecular docking, covid.
Downloads
Article Details
Authors who publish in PharmaCine: Journal of Pharmacy, Medical and Health Science agree to the following terms:
- Authors retain copyright and grant the journal right of first publication with the work simultaneously licensed under a Creative Commons Attribution-ShareAlike 4.0 International License that allows others to share the work with an acknowledgment of the work's authorship and initial publication in this journal.
- Authors can enter into separate, additional contractual arrangements for the non-exclusive distribution of the journal's published version of the work (e.g., post it to an institutional repository or publish it in a book), with an acknowledgment of its initial publication in this journal.
- Authors are permitted and encouraged to post their work online (e.g., in institutional repositories or on their website) prior to and during the submission process, as it can lead to productive exchanges, as well as earlier and greater citation of published work (See The Effect of Open Access).
PharmaCine : Journal of Pharmacy, Medical and Health Science by https://journal.unsika.ac.id/ is licensed under a Creative Commons Attribution-ShareAlike 4.0 International License.
You are free to:
- Share, copy and redistribute the material in any medium or format
- Adapt, remix, transform, and build upon the material for any purpose, even commercially.
- The licensor cannot revoke these freedoms as long as you follow the license terms.
References
Perdana Analekta Tiara, Permana Angga Aditya. 2021. Molecular Docking Senyawa Potensial Anticovid-19 Secara In Silico. JIKA (Jurnal Informatika) Universitas Muhammdiyah Tangerang.
Amin Saeful, Juanti Asti, Pratita Anindita Tri Kusuma, Adlina Salsabila. 2021. Penambatan Senyawa Anti Virus Sebagai Anti Covid-19 Terhadap Enzim Papain-Like Protease. Diseminasi, Tasikmalaya.
Manalu Rosario Trijuliamos. 2021. Molecular Docking Senyawa Aktif Buah dan Daun Jmabu Biji (Psidium Guajava L) Terhadap Main Protease Pada Sars-Cov-2. Forte Jurnal, Vol 01, No 02, Juli 2021.
Julianus Jeffry, Hendra Phebe, Hariono Maywan, Frederick Nico, Ardyantoro Satrion. 2021. Molecular Docking Study of Indonesian Phytochemicals as Inhibitor of 6-HB Formation by Binding to HR1 Subunit of SARS COV-2 S2 Protein. Indonesian Journal of Pharmacology and Therapi, Vol 2, No 3 (SD), 2021 : 144-151.
Hagar, M., Ahmed, H. A., Aljohani, G., & Alhaddad, O. A. (2020). Investigation of some antiviral N-heterocycles as COVID 19 drug: Molecular docking and DFT calculations. International Journal of Molecular Sciences, 21(11). https://doi.org/10.3390/ijms21113922
Manalu, R. T., Safitri, H., Sari, H. P., Devina, R., Irnawati, I., & Liliwana, E. A. (2021). ANALISIS IN-SILICO PENGHAMBATAN MAIN PROTEASE (MPRO) PADA SARS-CoV-2 OLEH SENYAWA AKTIF TEH HIJAU (Camelia sinensis). Jurnal Farmagazine, 8(2), 1. https://doi.org/10.47653/farm.v8i2.548
Rena, S. R., Nurhidayah, N., & Rustan, R. (2022). Analisis Molecular Docking Senyawa Garcinia Mangostana L Sebagai Kandidat Anti SARS-CoV-2. Jurnal Fisika Unand, 11(1), 82–88. https://doi.org/10.25077/jfu.11.1.82-88.2022
Bare, Y., Timba, F. N. S., Sari, D. R. T., Mago, O. Y. T., Nurak, M. M. D. 2022. Kajian in silico Penghambatan Spesifik 3C-like Protease SARS-CoV-2 Senyawa Quinic Acid, Gluconic Acid, dan Ferulic Acid pada Kulit Kopi. Jurnal Ilmiah Medicamento, 8(20), 93-98. https://doi.org/10.36733/medicamento.v8i2.3971
Fakih, T. M., Jannati, F. A., Meilani, A., Ramadhan, D. S. F., Darusman, F. 2022. Studi In Silico Aktivitas Analog Senyawa Zizyphine dari Bidara Arab (Zizyphus spina-
christi) sebagai Antivirus SARS-CoV-2 terhadap Reseptor 3CLpro. Jurnal Penelitian Kimia, 18(1), 70-79
Hidayat, S., Cahyohartono, A. Dewi, a. U., Mukminah, I. A., Sigalingging, O. S. 2021. Uji Aktivitas Senyawa Bahan Alam terhadap Enzim Mpro pada SARS-CoV-2 Secara In Silico. Jurnal Farmasi Dan Ilmu Kefarmasian Indonesia, 8 (3)
Shofi, M. 2021. Analisis Senyawa ɑ-spinasterol Pada Biji Trembesi (Samanea saman (jacq.) Merr) Terhadap Penghambatan 3C-like Protease SARS-CoV-2 Melalui Uji In Silico. Jurnal Sintesis., 2 (2), 74-88
Jannah Laila Roikhatul, Fadila Syananda Zahra, Aisa Elvira Ratna, Sanjaya I Gusti Made. 2020. Potensi Tanaman Tempuyung (Sonchus Arvensis L) Sebagai Penghambatan Glikoprotein 2019-Ncov Kode 6VSB. Unibersitas Negeri Surabaya.